1. При строительстве крысоклеток (равно как и иных крысопепятствий), главный принцип - всё хотя бы теоретически может быть погрызенно, погрызенно будет обязательно! Поэтому, никакой фанеры и вообще, древесины в любом её виде. Только сталь, стекло, возможно пластик (и то, далеко не всякий подойдёт и не везде его можно применить). Точнее говоря, если глухая стена клетки плотно прилегает к стене и даже в случае её угрызания, крыса не выберется наружу, то можно и дерево применять - но смысл делать заведомо угрызаемую конструкцию?
2. Можно и съёмную, главное условие - чтобы крысы не могли её изнутри выдавить.
3. В зависимости от сорта пластика. Обычные капроновые (как правило, чёрного цвета) крысам не нравятся, да к тому же, довольно неприятно пахнут. Из жесткого твёрдого пластика - вполне успешно народ использует. Ещё весьма хороши гофрированные пластиковые трубы - крысам очень удобно по ним лазить. Впрочем, не исключено, что ваши крысы могут полностью трубу (и не важно из какого они материала) игнорить - бывает и такое. Прозрачных встречать не доводилось и сомнеываюсь, что такие существуют.
4. Не совсем понял. А с какой целью их украшать? Т.е. можно конечно хоть лаком, хот ькраской, но зачем в клетке лишняя химия? Функционала она точно не добавит.