Учитывая, что это простейшие, как и наши ненавистные бебезии-риккетсии, то, наверное, основной способ заражения для декоративных крысей - внутриутробно.
А дезинфекцию - насколько я знаю, эти твари жить вне организма не могут. Для параноиков вроде меня следует промыть все, куда попадали выделения или слюна, этого должно хватить с излишком.