Имхо, при прочих равных условиях, духота не менее вредна, чем сквозняк. Это не повод ставить клетку на пути воздушного потока, разумеется, но и излишне затыкать все щели тоже не стоит. К тому же, если животное все равно гуляет по комнате - ближе к полу почти всегда немного дует, однако массово крысы от этого не простужаются...