Я думаю, постепенно крысы привыкнут к присутствию кошки. Но на первое время наверное нужно ограничить доступ кошки в помещение, где живут крыски. И допускать только под присмотром, запрещать кошке приставать к крысам (котята в большей степени, чем взрослые кошки, поддаются инстинктам и их нужно обязательно контролировать и воспитывать, что ЭТИХ мышек трогать НИЗЗЗЯЯЯЯ!)