Именно метит, а не писает? т.е. больших луж нет? если вдруг крыса начинает обильно мочиться, это повод провериться на сахар. Пьет как обычно? Проблем со здоровьем нет?
Если это просто метки... ну ничего особенного. Кто-то метит сильнее, кто-то меньше, это уж как повезет. Могу посоветовать не менять часто "прогулочные" покрывала (или по чему она у вас бегает...) Многие крысы, чувствуя, что их запах отсутствует, начинают метить с утроенным рвением.
и еще, крыса живет одна? Метки - элемент социального поведения, самоутверждаются они так. Могут и друг друга метить. И вообще часто бывает так - чем ласковее крыса, тем сильнее она метит руки, одежду людей. Проявляет таким образом свои эмоции, "говорит" о том, что человек для нее любимый, свой. Ничего тут не поделаешь, только принять все как есть:) Обычно метки не пахнут практически, проблемы в них не вижу.