А в той вет. клинике, где Вы были, разве не берут анализ на грибок? Ведь не важно с кого брать анализ, животное оно и есть животное. Не думаю, что у крыс грибки намного меньше, чем у собак...

После анализа можно будет и с препаратами определиться. Опять же таки, можно попробовать использовать препараты, которыми лечат тех же самых кошек или собак, за неимением специальных для крыс.
Попробуйте поискать врача, который смог бы адаптировать курс лечения для крысика.
Вот Валентин, он же иногда выписывает препараты, которые предназначены для других животных, а вовсе не для крыс. Просто дозировки очень маленькие.
Если Вам удасться найти просто грамотного ветеринара, даже если он никогда не занимался с крысами, уверена, он сможет сориентироваться.
Плохо, конечно, что до взятия анализа уже производилось лечение. Анализ может быть неверным или вообще не получиться.

Но, попытка не пытна, хуже не будет.
Удачи!